Ich habe da -abgesehen von einem Plugin, aber das schon seit der 11er Version- keine Probleme.
Apropos: verwendest du irgendwelche Plugins, die querschießen könnten?
Wenn ja, dann deaktiviere mal alle Plugins und schaue, ob der Firefox problemlos startet udn die Bookmarks geladen werden. Danach kannst du die Plugins nach und nach aktivieren und schauen, bei welchem der Fehler wieder auftritt.
Was du auch mal probieren könntest:
Benenne den Profilordner von Firefox mal um, bzw. verschiebe ihn in ein anderes Verzeichnis (Natürlich ohne laufenden Firefox)
Dann starte den Firefox - dabei wird dann ein neues Profil angelegt.
Du kannst dann mal versuchen, über die Bookmarkbibliothek eine der vermeintlich beschädigten Bookmarkbackups zu importieren.
Wenn die erfolgreich geladen werden, liegt es zumindest nicht an den Bookmarkdateien.